當上杉清定進駐駿府城休整，并等待巖代、磐城、陸前、陸中等國的己方軍勢合流之際，先行召開了軍議。

    在清定看來，此時鐵炮已經在扶桑的五畿七道諸國之中普及，為了避免家中之人擅自行動，以及主動向敵方發起一騎討的請求，他便借著召開軍議的機會，重點提醒了一下本莊繁長、善宗次、穴澤氏清、真壁宗干、鷲內秀定等家臣。同時，也還能讓其余家臣引以為戒。

    隨著火器的大規模裝備，清定已然認為在戰場上一騎討這樣的‘斗將’行為應該淘汰。他認為一軍之將的任務是在各自陣中主持大局，而不是像足輕、徒步武士那樣在前面廝殺。可就是有些家臣是屢教不改，始終保持著親自操刀上陣的習慣。

    曾經，上杉定虎在率軍經略會津四郡之際，就率寡兵于前線探查，結果遭到了蘆名家的大軍包圍。若不是麾下將士用命，她也很難做到全身而退。

    事后，清定就專門責備過上杉定虎：“身為一軍主將，絕不能魯莽行事，要慎重行事！本家不愁你不能戰斗，而是擔心你過于輕敵，你可別忘了令兄華岳光榮與本家對你的期望······”

    反過來，清定還不忘表揚了成熟穩重，且出身于足利將軍家奉公眾的同族老臣八條春綱：“如今家中之人皆驍勇善戰，但是平時里老成持重、治軍嚴明、熟悉兵法的，誰也比不上八條日向守。他的職責是在軍中運籌帷幄，決不會輕易出陣與敵人進行廝殺。”

    可是，清定苦口婆心的告誡，依舊杜絕不了家中之人好勇斗狠的風氣，本莊繁長、善宗次、穴澤氏清、真壁宗干、鷲內秀定等人在往后的日子里依然我行我素。不可否認的是，家中重臣帶頭沖鋒陷陣的確可起鼓舞士氣的作用。

    在上杉軍的本隊各部軍勢于東遠江諸郡進行聚集之際，清定還不忘命常陸出身的儒學者山崎秀仙起草檄文：

    自古君王臨御天下，皆正義居內以制邪魔，邪魔居外以事正義，未聞以邪魔居中而制天下也。自足利氏祚傾移，三筑以蕞爾波州入主雍州，至近畿四國，縱橫馳騁，此豈人力，實乃天授。彼時君明臣良，足以綱維天下，然達人志士，尚有殺伐過重之嘆。自是以后，乖張暴戾，屢出無名之師軍，勞民困人；又如滅人之宗，絕人之祀，至于民眾失所；不尊朝廷，幕府，上下相習，恬不為怪，其于父子君臣夫婦長幼之倫，瀆亂甚矣。夫人君者斯民之宗主，朝廷，幕府者天下之根本，禮儀者御世之大防，其所為如彼，豈可為訓于天下后世哉！及其后架空主家波州細川、京兆細川、足利將軍家，失君臣之道，又加以蠻橫專權，酷吏毒虐，萬民抱怨，于是人心離叛，諸國并起，使我天下之民，死者肝腦涂地，生者骨肉不相保，雖因人事所致，實乃天厭其德而棄之之時也。當此之時，天運循環，近畿氣盛，億兆之中，當降生圣人，驅除天魔，恢復光明，立綱陳紀，救濟斯民。今一紀于茲，未聞有治世安民者，徒使爾等戰戰兢兢，處于朝秦暮楚之地，誠可矜閔。予本越后刈羽三尺微命，因大亂，為眾所推，繼任家督，后冠坂東副帥，居小田原形式之地，戰甲信，平關東，攻東海，敗一向，興上杉，今二十年矣。民稍安，食稍足，兵稍精，控弦執矢，目視我近畿之民，久無所主，深用疚心。予恭承天命，罔敢自安，方欲遣兵西進上洛，拯生民于涂炭，復朝廷，幕府之威儀。慮民人未知，反為我仇，絜家北走，陷溺猶深，故先逾告：兵至，民人勿避。予號令嚴肅，無秋毫之犯，歸我者永安，背我者自竄。蓋我近畿之民，天必命我正義之人以安之，邪魔何得而治哉！予恐中土久污膻腥，生民擾擾，故率群雄奮力廓清，志在逐邪魔，除暴亂，使民皆得其所，雪天下之恥，爾民等其體之。故茲告諭，想宜知悉。

    鑒于細川晴元的嫡男細川聰明丸仍在三好長慶的手中，清定并沒有完全否定現任管領細川氏綱，避免三好長慶狗急跳墻。

    當然，清定還命早就暗中臣從上杉家的小川城城主多羅尾光吉、雨乞山城城主藤林保豐二人派遣麾下忍者，對三好家、六角家治下的近江、山城、攝津、大和、和泉、河內等國進行大肆襲擾，盡可能的阻撓三好家、六角家征召軍勢、調集糧草，從而減輕上杉軍上洛的阻力。

    而另一方面，足利義輝、三好長慶、六角義賢、朝倉義景、赤松晴政、仁木義視、本愿寺顯如等人可沒有坐以待斃，他們深知上杉家的兵甲之盛，難以匹敵，便相互之間積極聯系，并想方設法的拉攏更多的大名、國人領主們至己方，準備阻遏上杉家三道并進的勢頭。

    盡管足利將軍家的權威日益低下，但足利義輝還是與三好長慶、細川氏綱、六角義賢等人聯名對西國新崛起的大名毛利元就發去祝賀，希望毛利家能夠盡快穩定治下領國，并發兵上洛前來勤王。

    為了表示誠意，足利義輝授予了毛利元就御相伴眾的家格，以及朱柄傘、涂輿兩樣免許，直接讓其擁有了守護格。

    然而，不論伏見宮貞敦親王（二條晴良岳父）、寬欽法親王（勸休寺門跡，伏見宮貞敦親王次男）、堯尊法親王（妙法院門跡，伏見宮貞敦親王三男）、任助法親王（仁和寺門跡，伏見宮貞敦親王四男）二條晴良、九條稙通、高倉永家、廣橋國光、薄以緒等皇室、公卿好說歹說，后奈良天皇就是反對指認上杉清定為朝敵。

    加上時任關白近衛前嗣舉族經近江朽木谷后逃入若狹，使得朝廷之中的親上杉家一派公卿頓時失去了主心骨，根本無力阻止親三好家一派的公卿擅意妄為。