至此，不僅信濃守護小笠原家復興的希望破滅，甚至還喪失了在信濃一國的全部領地。信濃守護小笠原家作為大名而言已經滅亡。

    而村上家的處境也好不到哪里去，即便村上義清獲得了上田原之戰、砥石城之戰兩次大勝，可眼下卻逐漸處于劣勢，甚至還瀕臨四面楚歌的窘境。

    隨后，村上義清鑒于村上家在軍議評定決策之效率、戰敗恢復之速度、征發兵力勞役之規模、糧草輜重之通暢、領內府庫之厚薄、軍械裝備之精良、器械制作之高下、商旅周流之閉合、民氣戰心之高低等，樣樣都不及武田家的一半，可以說已經無力繼續在葛尾城支撐下去了。

    經過一番權衡后，村上義清便效仿小笠原長時那樣，棄城而逃，帶著家眷、部分家臣去投奔上杉家了。

    其實，村上義清自己都有些想不通，明明自己已經兩次打得武田晴信慘敗而歸，甚至還一度對武田家造成了重創，可為什么反而是村上家的領國范圍越來越小，武田家的領國范圍越來越大。