不過，神保長職也察覺到了越后上杉家即將出兵越中的跡象。他對此絲毫不敢怠慢，不僅下令重臣水越盛重加快對富山城筑城的進度，還下令東新川郡的飛驒守五郎左近尉、板屋政廣、總田太郎左衛門、狩野中務丞等旗下國人領主開始囤積糧草輜重，做好合戰的準備。

    在無法獲得越中、加賀兩國一向一揆眾支援的情況下，神保長職的策略就是扼守越中一國各處的重鎮要地，下令家中重臣、旗下國人領主進行節節抵抗，以拖延越后上杉軍的進攻速度，盡可能消耗越后上杉軍的軍事資源，為最后的決戰和反攻做好充分準備和贏得時間。

    而上杉清定這邊則是趁著自己在沒有外患的情況下，集中頸城郡、刈羽郡、魚沼郡、三島郡、水內郡一部的兵力出陣越中。至于自己一直不太放心的長尾俊景和長尾為重二人，清定則是留下了揚北眾諸將、長尾房景、須田為定、本莊實乃等人。

    天文九年，七月十日。

    在正式出兵越中之前，清定留下了八條春綱、八條能重、計見堯元、廣居忠家、石坂忠章、松木秀朝、黑金景信、藤目勝久等刈羽郡元從家臣，讓他們分別留守在頸城郡、刈羽郡、魚沼郡的等地擔任目付，監察留在越后一國的諸將。

    在安排好領內重鎮要地的防衛后，清定就以山本寺定長、村山直義、富永長綱三部作為先陣，柿崎景家、桃井義孝、安田景元三部作為次陣，市河賴房、北條高定兩部作為三陣，宇佐美定滿為軍師，直江景綱為小荷馱奉行，大熊朝秀為軍糧奉行，八條房繁為旗本前備兼任軍奉行，宇佐美定勝為旗本左備，八條廣繁、小島貞興二人為旗本右備，八條憲繁為旗本后備，栗林賴忠、福島政為兩部作為游軍，石川重久、齋木尚重兩部作為后陣，上條定賴、金津義舊、甘糟泰重、丸山昌明、平子房政、金子尚綱、發智長芳、大關親信、登坂清高、下平吉長、上野家成、福王寺孝重等部為本隊直轄軍勢，平田宗定、須田村定二人負責率越后水軍眾的絕大部分戰船襲擾富山灣一帶神保家治下的沿海地區，伺機攻打放生津以及府中城。

    為了更好的削弱神保家的戰力，使神保長職首尾難以兼顧。清定還特意派遣小島入道作為使者出使能登七尾城，請時任匠作畠山家家督、能登守護畠山義總出兵襲擾北射水郡。

    對于越后上杉家出兵牽制神保家的要求，畠山義總沒有拒絕。因為自從神保長職在神保家的舊臣們支持下舉兵后，就將匠作畠山家所領有的北射水郡蠶食鯨吞的就只剩下森寺城（湯山城）、八代城、阿尾城等幾座城池兵砦。

    故而，畠山義總早就想出兵收復舊領，只是因匠作畠山家與加賀一向一揆眾交惡的原因，不敢輕易出兵南下。如今，上杉清定已經被足利義晴補任為越中守護，有出兵救援椎名家之意，那么匠作畠山家也不必大舉出兵南下，只需派出部分軍勢南下射水郡伺機而動即可。

    在畠山義總看來，只要上杉清定能擊敗神保長職，那么自己就出兵收復射水郡的舊領；若是上杉清定沒能擊敗神保長職，那么自己就可以將進駐在能登、越中兩國境目地帶的軍勢撤回本領，以免遭到神保長職的打擊報復。

    隨著越中、加賀兩國的一向一揆眾經本誓寺超賢的斡旋，與越后上杉家保持了和睦，以及匠作畠山家有意再度介入越中射水郡的跡象，此時的神保長職可謂是內外交困。

    盡管神保長職對此感到怒不可遏，但絲毫不能改變眼下對神保家極為不利的局勢。

    天文九年，七月二十一日。

    在外交、軍事方面完全準備妥當后，清定就以一千余水軍眾、一千名苗字帶刀眾、兩百名馬廻眾、三百名龍捷備、三百名虎捷備、一千名常備足輕、八千五百余征召軍勢、陣夫一萬余人，共計兩萬兩千三百余人水陸并進出陣越中。

    越后上杉家的越中攻略正式拉開了序幕。

    越后上杉軍此次以海路為主要糧道，并以勝山城、清崎城、不動山城、能生城、德合城等西頸城郡的城池兵砦作為水陸補給樞紐，保障越后上杉軍的糧草輜重供應。

    原先臣從于椎名家旗下的魚津城城主板屋政廣、宮崎城城主宮崎太郎、若栗城城主總田太郎左衛門、館之城城主館彈正、舟見城城主飛騨守五郎左近尉等人深知自己無力抵御越后上杉軍的侵攻，皆不約而同地派遣使者前往富山城，請求神保長職出兵救援。

    可此時的神保長職才安排同族的神保氏純鎮守南射水郡不久，還好不容易征召了五千余軍勢，并裹挾了城生齋藤家、土肥家、石黑家等國人領主出陣東新川郡，意圖先將椎名家本據松倉城攻落。同時，還派遣了神保慶明、神保八郎左衛門等同族重臣前去擔任軍監，統轄東新川郡諸將于境川阻遏越后上杉軍的兵鋒。