東北在行動同時，西域也開始了對準噶爾部的打擊。

    經過一冬的養精蓄銳、積蓄糧彈，明軍以五萬之眾，分成西、北兩路向伊犁進軍。

    喀爾喀蒙古諸部也趁機出兵，向西進攻，夾擊準噶爾部。

    明軍行動神速，不到兩個月便逼近伊犁。

    永歷七年，順治十年，公元1653年，準噶爾部首領僧格接手了一個強大的部族。

    此時的準噶爾部實力強大，北及額爾齊斯河流域和鄂畢河中游，西至巴爾喀什湖以東，南至天山北路皆是準噶爾部的疆域。

    但準噶爾部并沒有因此走向新的輝煌，卻爆發了嚴重的內戰。

    僧格的異母兄車臣、卓特巴巴圖爾不服僧格，在屬地內舉兵叛亂。

    準噶爾部也因此分裂為支持僧格和支持叛軍