在原作的第一部快要完結時，主角團們會知道一個，對于他們來說極其殘酷的，有關整個世界的真相。

    從來就沒有所謂的寬恕和原諒，人類始終是赤與藍之神的棄民，蓋亞教廷對當年所述的一切全是謊言。

    七賢者的死因并不是自裁謝罪，實際上他們從未向神靈屈服過，如今的人世間都是他們奮戰的結果。

    所謂的神造之神赫爾梅斯，實際上是一種類似高達機甲的巨型構物，由黑白使徒作為其核心操控它進行滅世。

    在當年那場千年滅世之中，負責操控赫爾梅斯的白翼使徒伊麗絲，在關鍵時刻被七賢者之首伊扎克成功策反。

    他們聯合起來襲擊了黑翼使徒伊邪麗絲，雖然沒有將她徹底消滅，但也成功斬斷半邊翅膀，導致黑翼使徒隕落。

    隨著白翼使徒被策反，并導致了黑翼使徒的隕落，神造之神赫爾梅斯終于停止，赤與藍之神授意的滅世也無果而終。

    之后七賢者與白翼使徒繼續聯合，讓白翼使徒伊麗絲假扮為現世神蓋亞，編造了如今蓋亞教廷的宣傳口徑。

    但他們確實終止了假學的傳播，因為說到底使徒并不是主人，無法真正的操控神造之神赫爾梅斯。

    如果讓假學繼續在世界傳播，黑霧污染的面積持續不斷擴大，那么就會有新的黑白使徒誕生，操控赫爾梅斯完成那未完成的滅世。

    所以七賢者主導成立的蓋亞教廷，才以一種一刀切的方式，將舊日假學的一切給盡數埋葬。

    還在蓋亞教廷之上成立秘密的內院，他們清楚千年滅世時發生的許多真相，職責就是在七賢者都不在以后，繼續領導這個世界埋葬假學。

    白翼使徒伊麗絲的壽命并非無限，當她死后由提前培養的復制人，繼續扮演現世神蓋亞的角色，于是真相就這么被一代代的隱瞞與傳遞下去。

    然而等到系列的第二部時，新一批主角團們才會在不斷的冒險中，知道了真相背后的真相。

    赤與藍之神并非是世界的創造者，他們是從外星降臨而來的侵略者，這個世界真正的神靈是所謂“綠之神”。

    綠之神作為土著神靈，根本無法擊敗能夠星際旅行的赤與藍之神，于是縮到了世界最深處茍延殘喘。

    但他終究是這個世界的本源意識，權柄并沒有被徹底剝奪，所以依舊能夠通過另一種形式，不斷影響被赤與藍之神掌控的外界。

    比如黑霧在正常情況下，是不會造成前文提到的那種影響，只是一種正常的污染現象而已。